05/11/2021

We are looking for a highly motivated and self-driven post-doctoral researcher to join our Molecular Microbiology group at the Department of Pharmacological and Biomolecular Sciences at the University of Milano (Italy). The available position is a “Assegno di ricerca di tipo B” for 1 year, renewable for 2 additional years and available from March 2022.

Fighting antibiotic resistance is a priority of the public health agenda, and new antibacterial drugs are urgently needed. The characterization of novel cellular targets and the development of antimicrobials with novel mechanisms of action have become essential to tackle the spread of resistance and to control multidrug resistant bacterial infections.

Our group has long been involved in the study of cell envelope biogenesis in Gram-negative bacteria and has contributed to the identification and characterization of the molecular machine that transports lipopolysaccharide (LPS) to the cell surface, using E. coli and P. aeruginosa as model systems. The LPS transport system is essential and highly conserved among Gram-negative bacteria, and hence an ideal source of new targets for antibacterials.

The applicant will join a stimulating international group and will be involved in the development and application of a new HTS system for the screening of compounds effective against LPS biogenesis. Moreover, the applicant will be involved in the generation of E. coli conditional mutants in envelope biogenesis genes, previously selected as putative targets of antibacterials, for the characterization of inhibitors identified by virtual screening.

The candidates must hold a Ph.D. and demonstrated expertise in bacteriology, molecular biology, and biochemistry. The candidate is expected to work independently and integrated with the other people of the group.

Applicants are invited to submit their Curriculum Vitae, including list of publications, and contact information of two referees to Dr. Paola Sperandeo at paola.sperandeo@unimi.it.

 

28/07/2021

Presso il Dipartimento di Scienze dell’Università Roma Tre, nel laboratorio di Microbiologi Molecolare diretto dal Prof. Paolo Visca (E-mail: paolo.visca@uniroma3.it; Skype: paolo.visca; https://orcid.org/0000- 0002-6128-7039) sono disponibili posizioni di Dottorato di Ricerca e un assegno di ricerca pluriennale per ricerche in tema di genomica funzionale di procarioti.

I candidati per le posizioni di dottorato di ricerca devono essere in possesso di laurea magistrale attinente al tema generale della ricerca (Biologia con indirizzo bioinformatico, Bioinformatica, Fisica con indirizzo biofisica, Ingegneria informatica, Informatica ecc.) e devono avere maturato una esperienza pratica in ambito bioinformatico durante la preparazione della tesi magistrale. Specifiche competenze richieste: Uso di ambienti linux e almeno un linguaggio di programmazione (Perl, Python, R); conoscenza di procedure bioinformatiche di analisi dati, banche dati biologiche e accesso programmatico a tali risorse; esperienza nell’analisi di dati da next generation sequencing.
La durata del dottorato è 3 anni e l’importo mensile della borsa è circa 1.150 euro. Il bando di concorsuale si apre a giugno di ogni anno.

I candidati per la posizione di assegno di ricerca pluriennale devono avere svolto un dottorato di ricerca strettamente attinente al tema generale della ricerca, documentato da adeguate pubblicazioni scientifiche. Specifiche competenze richieste:
Oltre alle competenze sopra indicate per i dottorandi, si richiede esperienza documentabile nell’analisi di dati “omics”, in particolare resequencing, de novo sequencing, analisi metagenomica (16S e ITS) e conoscenza di procedure bioinformatiche di analisi dati (es.: paired-end reads alignment, data filtering, variant calling). Costruzione e analisi di MAGs (metagenome-assembled genomes). Esperienza in assembly e annotazione di genomi batterici. Esperienza nell’analisi di resistenze batteriche, elementi trasponibili, plasmidi e analisi filogenetica. Esperienza nello sviluppo di pipeline di bioinformatica. Classificazione tassonomica, studi di genomica comparativa.

La durata dell’assegno è annuale rinnovabile fino a un massimo di 6 anni e l’importo del salario mensile varia da circa 1.450 circa 1.600 euro. Il bando di concorsuale sarà a ottobre 2021 (pubblicazione sul sito https://app.scienze.uniroma3.it/acts?typology=4).

Per contatti preliminari fare riferimento al responsabile delle ricerche Prof. Paolo Visca
(https://orcid.org/0000-0002-6128-7039):
E-mail: paolo.visca@uniroma3.it
Skype: paolo.visca

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